A Escola Secundária Garcia de Orta foi criada pelo Decreto 45636 de 31 de Março de 1964 com a designação de Liceu, que era o modelo pedagógico que lhe correspondia . O seu primeiro Reitor foi nomeado a 18 de Setembro de 1969. Tal como outras escolas inauguradas na vigência do ministro da educação Veiga Simão, o Garcia de Orta beneficiou de uma certa abertura pedagógica – turmas mistas de rapazes e raparigas, professores e famílias disponíveis para acolher novas experiências didáticas. Foi também a primeira escola no Porto a ter Associação de Pais, Seguro Escolar, Infantário e gabinete Psicopedagógico. Nunca aí funcionou a Mocidade Portuguesa (M.P.) e os cadernos, em vez do emblema da M.P., tinham a biografia do patrono da escola. As visitas de estudo, sessões de movimento e drama e saraus musicais implicavam com grande empenho grupos de professores mais avançados pedagogicamente e alunos.
O 25 de Abril veio, assim, encontrar uma Escola que ensaiava já alguma inovação, que beneficiava da organização (ainda que não oficializada) de grupos de trabalho e debate sobre novas pedagogias e que tinha aberto espaços de liberdade de expressão aos alunos mais atentos à realidade social. Claro que a nova realidade política teve um impacto forte em toda a comunidade escolar, embora os novos conselhos diretivos, os professores, alunos e famílias tenham com sucesso e rapidamente retomado toda a operacionalidade necessária ao bom aproveitamento habitual.
Em 1974 o “Liceu” passa a designar-se “Escola Secundária”, alteração que reflete a preocupação política e ideológica da época e que visava anular a diferença entre ensino técnico e ensino liceal, o primeiro subalternizado socialmente face ao segundo.
Passando por diversas experiências pedagógicas, o Garcia de Orta aderiu com êxito ao projeto de «Escola Cultural» desenvolvido desde os anos 80 com a colaboração do Instituto de Inovação Educacional e outras instituições. Recentemente, passou a ser a primeira escola do país a criar uma secção bilingue (vertente francês).
As comemorações do 25º e do 35º Aniversários da Escola foram momentos altos de vivência para a comunidade escolar, nelas tendo sido envolvidos antigos alunos, pais, professores e funcionários.
Escola com uma dinâmica muito acentuada e bons resultados académicos, atrai os alunos para a sua frequência. Uma excelente biblioteca, laboratórios bem equipados, áreas sociais e desportivas de qualidade, são contributos decisivos para o seu sucesso.
Atualmente, o “Garcia” enfrenta, mais uma vez, um momento de mudança: um novo edifício equipado com as mais atuais tecnologias e um novo modelo de direção constituem um desafio a que toda a comunidade escolar está disponível para responder com inovação e rigor.